De carro: para chegar a Paraty, a partir do Rio de Janeiro, acessar a rodovia BR-101, conhecida como Rio-Santos. A estrada, uma das mais belas do estado do RJ, percorre a região da Costa Verde. Do Rio até Paraty são 240 km.
De São Paulo, o acesso é pela Rodovia Ayrton Senna até São José dos Campos ou Taubaté. Via São José dos Campos, o acesso é pela Rodovia dos Tamoios até Caraguatatuba. Já por Taubaté, o acesso é pela Rodovia Oswaldo Cruz até Ubatuba. Em ambos os casos, Caraguatatuba ou Ubatuba, o percurso até Paraty é pela rodovia BR-101, conhecida como Rio-Santos, na direção norte, sentido Rio de Janeiro. Se for a partir de Guaratinguetá, seguir pela Estrada- Parque Paraty-Cunha.
Fique atento: o único acesso terrestre à Reserva Ecológica Estadual da Juatinga (REEJ) se dá na Vila do Oratório. De Paraty, seguir pela BR-101, sentido Santos, até o trevo do bairro Patrimônio, pertencente ao município de Paraty, e subir à esquerda por uma estrada asfaltada até a bifurcação para a Estrada de Laranjeiras. Após passar pela guarita do condomínio Laranjeiras, virar à esquerda para chegar à Vila Oratório e seguir até o ponto final dos ônibus, onde inicia a trilha Vila Oratório – Praia do Sono.
São cerca de 45 minutos de trilha até a Praia do Sono. A partir da Vila Oratório também é possível contratar um bote para chegar às localidades de Praia do Sono e Ponta Negra. Na Vila Oratório existem estacionamentos particulares e algumas vagas públicas em ruas.
De barco para outros locais da Reserva, os pontos de embarque são: Paraty-Mirim, o cais turístico de Paraty e o cais pesqueiro de Paraty. O cais turístico fica na parte histórica da cidade, enquanto que o cais pesqueiro localiza-se no bairro Ilha das Cobras. Paraty-Mirim é uma localidade estratégica para acessar o Saco do Mamanguá, praias da Enseada da Cajaíba e Martim de Sá. Para chegar à praia de Paraty-Mirim a partir de Paraty, o visitante deve acessar a BR-101 em direção a São Paulo, até o km 154,5. Em seguida é necessário entrar à esquerda e seguir por uma estrada ainda não pavimentada por aproximadamente 7 km. Em Paraty-Mirim existe estacionamento particular e algumas vagas públicas em rua.
A partir da rodoviária de Paraty, o percurso Paraty-Vila Oratório: ônibus da linha Paraty - Vila Oratório; o percurso Paraty-Paraty-Mirim: ônibus da linha Paraty-Paraty-Mirim.