Próximo à sede do parque, a Trilha do Sahy começa na base da histórica Pedra da Conquista.
O caminho sobe gradativamente o vale acompanhando o rio de mesmo nome e os inúmeros poços. Termina em um mirante em que é possível apreciar a fascinante vista das ilhas da baía de Sepetiba e do Vale do Sahy, e ainda outras áreas protegidas, como o Parque Estadual da Ilha Grande.
  Percurso :  2,2 km.
  Duração : 45 minutos a 1 hora.
  Grau de Dificuldade :  Leve.
Muito conhecida entre os montanhistas, a entrada da trilha para a subida das Três Orelhas tem traçado bem definido. Um caminho suave corta a encosta até atingir a vertente sul da Serra do Mar, em que passam a predominar os trechos íngremes das escarpas, dificultando a caminhada. Durante o percurso, belíssimos trechos de Mata Atlântica bem preservada, mirantes e cachoeiras.
  Percurso :  8,6 km.
  Duração : 6 horas.
  Grau de Dificuldade :  Pesado.
A Pedra Chata é provavelmente uma das montanhas mais conhecidas e visitadas do parque. Durante o percurso é possível observar paisagens de rara beleza cênica, atravessando um belo trecho de Mata Atlântica, antes de atingir o cume, que oferece vista panorâmica tanto para o Vale do Paraíba quanto para o mar, sendo possível ver a Pedra da Gávea em dias límpidos. A caminhada é longa, mas a trilha apresenta boas condições em todo seu trajeto.
  Percurso :  3,4 km.
  Duração : 3 horas.
  Grau de Dificuldade :  Pesado.
A trilha oferece uma bela vista para todo o Vale do Rio das Pedras, destacando-se a Pedra Chata como um dos pontos mais altos. O caminho é compartilhado com a Trilha da Pedra Chata, devendo o caminhante bifurcar à esquerda após uma clareira (pastagem). A subida, a partir da bifurcação, é bastante íngreme.
  Percurso :  3,3 km.
  Duração : 3 horas.
  Grau de Dificuldade :  Moderado.
A trilha oferece uma bela vista para todo o Vale do Rio das Pedras, destacando-se a Pedra Chata como um dos pontos mais altos. O caminho é compartilhado com a Trilha da Pedra Chata, devendo o caminhante bifurcar à esquerda após uma clareira (pastagem). A subida, a partir da bifurcação, é bastante íngreme.
  Percurso :  3,0 km.
  Duração :  4 horas.
  Grau de Dificuldade :  Moderado.
Trata-se, sem dúvida, da travessia mais conhecida, seguindo a ferrovia que liga a cidade de Angra dos Reis, no litoral, a Lídice, na serra. Apesar do desnível entre as duas cidades, a extensão da caminhada, originalmente projetada para servir como Estrada de Ferro, torna-se quase imperceptível.
Durante o percurso, podendo variar conforme o planejamento do visitante, o caminhante passará por diversos túneis sem iluminação, estações antigas, poços para banho, muitos mirantes e algumas pontes (que podem gerar vertigem nos menos experientes). Atualmente a ferrovia encontra-se desativada.
Fique atento com as passagens bem altas em algumas pontes durante o percurso, sendo que alguns dormentes se apresentam bastante deteriorados, havendo sempre um potencial risco de acidente.
  Percurso :  43 km.
  Duração : 2 a 3 dias.
  Grau de Dificuldade :  Pesado.